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分子生物學的名字詳解
基因與基因組
Gene基因:基因是DNA分子上具有遺傳效應的特定核苷酸序列的總稱,是具有遺傳效應的DNA分子片段。
interruptesd或discontinuousgene不連續(xù)基因:真核生物的基因編碼順序在DNA分子上是不連續(xù)的,被非編碼順序隔開。
Exon外顯子:是一個基因表達多肽鏈的部分。
Intron內(nèi)含子:內(nèi)含子只轉(zhuǎn)錄,在前mRNA(pre-mNRA)時被剪切掉。Promoter啟動子:能促進轉(zhuǎn)錄過程。
Microarray微陣列:大規(guī)?焖贆z測基因差異表達、基因組表達譜、DNA序列多態(tài)性、致病基因或疾病相關基因的一項研究基因功能的新技術。
Geneknockin基因敲入:轉(zhuǎn)基因(基因過表達)。
Geneknockout基因敲除;又稱基因打靶(genetargeting):用外源DNA與受體細胞基因組中順序相同或者非常相近的基因發(fā)生同源重組,整合,使特定的基因失活或缺失的技術。genemutation基因突變:從分子水平上看,基因突變是指基因在結(jié)構(gòu)上發(fā)生堿基對組成或排列順序的改變。
pointmutation點突變:由于DNA堿基對的置換、增添或缺失而引起的基因結(jié)構(gòu)的變化,亦稱點突變。
genedisease基因。菏侵富蛲蛔兓蚱浔磉_調(diào)控障礙引起的疾病。
overlappinggene基因重疊:即同一段DN段能夠編碼兩種甚至三種蛋白質(zhì)分子。Genefamily基因家簇:有許多來源相同、結(jié)構(gòu)相似、功能相關的基因組成為單一基因簇或基因家簇。
supergengfamily超基因家族:更大的基因家族,起源于相同的祖先基因,功能卻并不相同。
Pseudogenes假基因:DNA序列與功能基因相似但不產(chǎn)生有功能的基因產(chǎn)物。
Telomere端粒:以線性染色體形式存在的真核基因組DNA末端膨大結(jié)構(gòu),稱為端粒。humangenomics人類基因組
DNAFingerprintDNA指紋技術:DNA指紋技術作為一種遺傳標記。
復制、損傷和修復
Replication,DNAbiosynthesisDNA的復制:指DNA雙鏈在細胞分裂以前進行的復制過程。semi-conservativereplicationDNA的半保留復制:DNA在復制時,以親代DNA的每一股作模板,合成完全相同的兩個雙鏈子代DNA,每個子代DNA中都含有一股親代DNA鏈。Primer引物:常是RNA
primase,DnaG引物酶:用于合成復制所必需的RNA引物。
HelicaseDnaB解螺旋酶:由DnaA和DnaC協(xié)助在復制的起始點(OriC)上解開雙螺旋。Ori復制起始點:DNA復制要從DNA分子的特定部位開始,此部位稱復制起始點。DNApolymeraseDNA聚合酶:依賴于DNA的DNA聚合酶。
topoisomeraseI、II拓撲異構(gòu)酶:使DNA鏈發(fā)生斷裂和再連接,引入負超螺旋。SSB單鏈DNA結(jié)合蛋白:防止單鏈DNA重新形成雙鏈,防止單鏈DNA被核酸酶水解。Primosome引發(fā)體:包括解螺旋酶、DnaC、引物酶及DNA復制的起始區(qū)域。
Telemer端粒:指真核生物染色體線性DNA分子末端的結(jié)構(gòu)。
semi-discontinuousreplication半不連續(xù)復制:領頭鏈連續(xù)復制而隨從鏈不連續(xù)復制,就是復制的半不連續(xù)性。
Replicon基因組能獨立進行復制的功能單位稱為復制子。
leadingstrand領頭鏈:以3'→5'方向的親代DNA鏈作模板的子代鏈在復制時基本上是連續(xù)進行的,其子代鏈的聚合方向為5'→3',這一條鏈被稱為領頭鏈。
laggingstrand隨從鏈:而以5'→3'方向的親代DNA鏈為模板的子代鏈在復制時則是不連續(xù)的,其鏈的聚合方向也是5'→3',這條鏈被稱為隨從鏈。Okazakifragment岡崎片段:DNA在復制時,由隨從鏈所形成的一些子代DNA短鏈稱為岡崎片段。
LigaseDNA連接酶:將不連續(xù)的DN段以3’,5’磷酸二酯鍵連接起來。
Telomerase端粒酶:端粒酶是一種RNA-蛋白質(zhì)復合體,它可以其RNA為模板,通過逆轉(zhuǎn)錄過程對末端DNA鏈進行延長。
Telomere端粒:染色體線性DNA分子末端。
D-loopreplicationD環(huán)復制:是線粒體DNA(mitochondrialDNA,mtDNA)的復制形式。Mutation突變:由自發(fā)的或環(huán)境的因素引起DNA一級結(jié)構(gòu)的任何異常的改變稱為DNA的損傷,也稱為突變。
lightrepairing光復活:這是一種廣泛存在的修復作用。光復活能夠修復任何嘧啶二聚體的損傷。
excisionrepairing切除修復:這也是一種廣泛存在的修復機制,可適用于多種DNA損傷的
修復。(參與酶:外切酶,聚合酶,連接酶)
recombinationrepairing重組修復:這是DNA的復制過程中所采用的一種有差錯的修復方式。
SOSSOS修復:DNA分子受到長片段高密度損傷,使DNA復制過程在損傷部位受到抑制。損傷誘導一種特異性較低的新的DNA聚合酶,以及重組酶等的產(chǎn)生。由這些特異性較低的酶繼續(xù)催化損傷部位DNA的復制,復制完成后,保留許多錯誤的堿基,從而造成突變。
inverserestrictionsitemutation,iRSM反向限制性酶切位點突變分析法:iRSM適用于快速檢測誘變劑所致體內(nèi)外DNA的突變,這些突變的特點是使某一酶切位點變?yōu)榱硪幻盖形稽c。
轉(zhuǎn)錄及其調(diào)控
Transcription轉(zhuǎn)錄:遺傳信息由DNA轉(zhuǎn)換到RNA的過程。
templatestrand模板鏈:指導RNA合成的一股DNA鏈稱為模板鏈。
codingstrand編碼鏈:與之相對的另一股鏈。
RNApolymeraseRNA聚合酶:以DNA為模板轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生互補RNA的酶(不需要引物,無校對功能)
cis-actingelement順式作用元件:轉(zhuǎn)錄起始前的上游區(qū)具有啟動子核心序列。不同物種、不同細胞或不同的基因轉(zhuǎn)錄起始點上游有不同的DNA序列。(包括啟動子,啟動子上游元件和增強子)
trans-actingfactors反式作用因子:能直接、間接辨認和結(jié)合轉(zhuǎn)錄上游區(qū)段DNA的蛋白質(zhì)。
transcriptionalfactors,TF轉(zhuǎn)錄因子:反式作用因子中,直接或間接結(jié)合RNA聚合酶的蛋白質(zhì)。
pre-initiationcomplex,PIC轉(zhuǎn)錄起始復合物:真核生物RNA聚合酶不與DNA分子直接結(jié)合,而需依靠眾多的轉(zhuǎn)錄因子,形成轉(zhuǎn)錄起始復合物。
hnRNAmRNA前體
splicing剪接
Extron外顯子:RNA中被剪接后仍然存在能夠編碼表達蛋白質(zhì)的序列,同時可以指相應的DNA序列。RNAeditingRNA編輯:RNA編輯是指在mRNA水平上改變遺傳信息的過程。
ControlofProkaryoticGeneExepression原核生物轉(zhuǎn)錄調(diào)控:主要在轉(zhuǎn)錄起始水平調(diào)控Opron操縱子:一個基因簇受到同一的調(diào)控,這一個完整的調(diào)節(jié)系統(tǒng)包括結(jié)構(gòu)基因和控制這些基因表達的元件,形成了一個共同的調(diào)節(jié)單位,這種調(diào)節(jié)單位就稱為操縱子。
Positiveregulation正調(diào)控:誘導物與蛋白質(zhì)結(jié)合形成激活子復合物,激活子復合物與基因啟動子DNA序列結(jié)合,激活基因啟動轉(zhuǎn)錄,成為正調(diào)控。
Negativeregulation負調(diào)控:阻遏蛋白分子與基因啟動子DNA序列結(jié)合,阻礙RNA聚合酶的工作,使基因處于關閉狀態(tài),成為負調(diào)控。
Induction誘導:特殊底物的存在導致了酶的合成。
inducibleoperon可誘導操縱子:在缺乏誘導物時,這類操縱子只有本底水平的表達,約為誘導時表達水平的0.1%左右。
tryptophaneoperon色氨酸操縱子:一種衰減調(diào)控模式,Trp足夠時,操縱子自動關閉,Trp缺乏時,操縱子被打開,產(chǎn)生酶催化合成Trp。
Attenuator衰減調(diào)控:當Trp達到一定濃度,但還沒有高到能夠活化R使其起阻遏作用的程度時,產(chǎn)生Trp合成酶類的量已經(jīng)明顯降低,而且產(chǎn)生的酶量與Trp濃度呈負相關。Enhancer增強子:遠離轉(zhuǎn)錄起始點,決定基因的時間、空間特異性表達、增強啟動子轉(zhuǎn)錄活動的DNA序列。Silencer沉默子:負性調(diào)節(jié)元件,是負調(diào)節(jié)蛋白的結(jié)合位點。Insulator絕緣子:阻止激活或阻遏作用在染色體上的傳遞,使染色體活性限定在結(jié)構(gòu)域內(nèi)。Helisx-turn-helixHTH螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋:最常見DNA結(jié)合域之一,α螺旋識別、進入DNA雙路選結(jié)構(gòu)的大溝。
Zinc-finger鋅指:
Leucine-zippers亮氨酸拉鏈:一段肽鏈中每隔7個AA即有一個leuα螺旋。
翻譯及調(diào)控
proteinbiosynthesis蛋白質(zhì)生物合成:是指DNA結(jié)構(gòu)基因中貯存的遺傳信息,通過轉(zhuǎn)錄生成mRNA,再指導多肽鏈合成的過程。蛋白質(zhì)的生物合成過程也稱為翻譯(translation)。
Degeneracy簡并性:多數(shù)氨基酸擁有一個以上的密碼子;多少與該氨基酸在生物中的利用度相關。
Wobble擺動性:密碼子與反密碼子配對的擺動現(xiàn)象。
geneticcode遺傳密碼:
readingframes閱讀框架:mRNA中的一段含有翻譯密碼的堿基序列。
開放閱讀框架:從起始密碼AUG開始到終止密碼子處的正確可讀序列。
Initiation起始:mRNA、起始氨基酰-tRNA分別與核糖體結(jié)合而形成翻譯起始復合物的過程。
Elongation延伸:在mRNA密碼序列的指導下,由特異tRNA攜帶相應氨基酸運至核糖體的受位,使肽鏈依次從N端向C端逐漸延伸的過程。
Termination&Release終止與釋放:當A位上出現(xiàn)終止密碼時,釋放因子(releasingfactor,RF)進入,促進酯鍵水解,之后,tRNA和mRNA被釋放,核糖體大、小亞基解聚,解聚的大、小亞基參與下一輪翻譯過程。ribosomecycle核蛋白體循環(huán):當一條多肽鏈合成結(jié)束后,核蛋白體大小兩個亞基解聚,解聚后的大小亞基可以重新參與一條新的多肽鏈的合成,這就構(gòu)成了核蛋白體循環(huán)。molecularchaperone分子伴侶:分子伴侶是指能夠結(jié)合和穩(wěn)定另外一種蛋白質(zhì)的不穩(wěn)定構(gòu)象,并能通過有控制的結(jié)合和釋放,促進新生多肽鏈的折疊、多聚體的裝配或降解及細胞器蛋白的跨膜運輸?shù)囊活惖鞍踪|(zhì)。
heatshockprotein,hsp熱休克蛋白:hsp60和hsp70,前者幫助尚未折疊或錯誤折疊的多肽鏈形成正確的折疊,而后者可以和新生肽鏈結(jié)合,防止其聚集,有利于正確折疊的形成。chemicaledit化學編輯:蛋白質(zhì)翻譯后添加化學基團的這一類的加工修飾方式稱為化學編輯。
boundribosome附著核糖體:附著于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上的核糖體。
freeribosome游離核糖體:散在于胞質(zhì)中核糖體。
EndoplasmicReticulum,ER
RER粗面內(nèi)質(zhì)網(wǎng):表面附著大量核糖體,以扁囊為主,少數(shù)管狀和泡狀結(jié)構(gòu);管腔與核膜腔相通,有的細胞中與核膜呈同心圓分布,圍繞在核的周圍。
SER滑面內(nèi)質(zhì)網(wǎng):膜面光滑,以分支小管和小泡相互交織形成網(wǎng),與RER相通。
proteintargeting蛋白質(zhì)靶向:蛋白質(zhì)合成后被精確地運輸?shù)剿麄冃惺构δ艿牟课唬@個過程稱為蛋白質(zhì)的分選和運輸,又可稱為蛋白質(zhì)靶向。
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